LabDAO brėžia atvirojo kodo AI ateitį narkotikų atradimui

Projektas Folding@home per COVID-19 pandemiją pateko į antraštes apie nepanaudotos skaičiavimo galios panaudojimą, kad būtų galima ištirti baltymų lankstymo paieškos erdvę, kad būtų galima kovoti su naujuoju koronavirusu. Suteikdama piliečiams galimybę būti pačiais mokslininkais, iniciatyva atliko didelio masto skirtingų baltymų molekulinių konfigūracijų modeliavimą paskirstytame „užregistruotų“ kompiuterių tinkle visame pasaulyje.

Ši decentralizuota paradigma buvo skelbiama siekiant suburti žmones bendrai problemai spręsti ir efektyviai naudoti minios šaltinius, tačiau kas būtų, jei skaičiavimo galia ir problemų sprendimo infrastruktūra būtų atvirkščiai? Kitaip tariant, kas būtų, jei asmenys galėtų vykdyti savo projektus, pasinaudodami sukaupta skaičiavimo galia ir biologinio eksperimento įrankiai?

LabDAO šią svajonę paverčia realybe su savo PLEX platforma. PLEX yra atvirojo kodo komandinės eilutės įrankis, sukurtas tam, kad būtų galima pasiekti ne tik skaičiavimo išteklius, bet ir įvairius biologinio-mašininio mokymosi įrankius (sukurtą „BioML“ rinkinį LabDAO viduje) įvairiomis aplinkybėmis. Nesvarbu, ar eksperimentuojate su mažų molekulių prijungimu ar baltymų lankstymo modeliavimu, PLEX leidžia vartotojams greičiau nei per penkias minutes prisijungti prie LabDAO įrankių bibliotekos, dalytis rezultatais ir juos vizualizuoti.

Šis įrankių rinkinys ir ant jo esanti platforma, leidžianti naudoti, buvo pristatyta balandžio pradžioje Zuzalu vykusiame aukščiausiojo lygio susitikime Blockchain Meets Biology, kur LabDAO pagrindinės komandos narė Lily Hansen-Gillis nuo pradžios iki pabaigos demonstravo vidinės molekulinės dinamikos modeliavimą. baltymą, kad rastų stabiliausią konfigūraciją. Tada, kaip save vadinanti „nekoduotoja“, ji supažindino auditoriją nuo pradžios iki pabaigos – su kompiuteriu, „WiFi“, PLEX komandinėje eilutėje ir nieko daugiau.

Žvelgiant plačiau, LabDAO yra žiniatinklio 3 palaikanti decentralizuota platforma (didesnio „DeSci“ judėjimo dalis), skirta sukurti produktyvesnę aplinką atvirojo kodo vaistų atradimams. Suteikdama pažangiausius įrankius ir išteklius platesnei ekosistemai, LabDAO siekia sukurti tinkamą aplinką skaidriai ir prieinamai mokslo pažangai. Nesvarbu, ar tyrėjams nebereikės turėti savo aparatinės įrangos ar skaičiavimo infrastruktūros, ar eksperimentų rezultatus skelbdama blokų grandinės knygoje taip, kad juos būtų galima sekti ir atkurti, organizacija yra įsipareigojusi bendradarbiaujant sukurti daugiau naujovių – panaikinti kliūtis, kurias sukelia prastas trūkumas. patogumas naudoti ir nišinė patirtis.

LabDAO pastangos sukurti šį ateities DeSci pasaulį šiandien sulaukė postūmio 3.6 mln. USD finansavimo būdu iš įvairių kitų DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan ir kitų. Šis paramos antplūdis prisidės prie nuolatinių pastangų kurti atvirojo kodo programinės įrangos įrankius ir sustiprinti LabDAO tyrimų ekosistemą.

Kalbant apie patį PLEX, artimiausi žingsniai horizonte apima platformos išbandymą įvairiuose moksliniuose bendradarbiavimuose, įvairių įrankių talpinimą ir reikalingos aparatinės įrangos kaupimą BioML tinklui puoselėti.

Kalbant apie ilgalaikę perspektyvą, galbūt kitas gyvybę gelbstintis vaistas per kitą didelį infekcinės ligos protrūkį bus sukurtas naudojant PLEX, decentralizuotą žingsnį į priekį vienu metu. Ekosistemai toliau augant, parodys tik laikas.

Ačiū Aishani Aatresh papildomų tyrimų ir pranešimų apie šį straipsnį. Esu „SynBioBeta“ įkūrėjas, o kai kurios įmonės, apie kurias rašau, yra jos rėmėjos „SynBioBeta“ konferencija. Norėdami gauti daugiau turinio, galite užsiprenumeruoti mano savaitinis naujienlaiškis.